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eDNA魚類種群采樣調查系統(tǒng)

產品簡介

eDNA魚類種群采樣調查系統(tǒng)環(huán)境 DNA(environmental DNA, eDNA)是指可以從環(huán)境樣品(如水、土壤、空氣、冰芯等)中直接提取到的DNA 片段總和。eDNA 技術是近年來新出現(xiàn)的一種生物調查方法技術,

產品型號:
更新時間:2022-09-20
廠商性質:代理商
訪問量:2181
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水環(huán)境eDNA解決方案

                                      ——水環(huán)境eDNA便攜采集系統(tǒng)-生物調查物種入侵調查

前言:

eDNA魚類種群采樣調查系統(tǒng)環(huán)境  DNA(environmental DNA, eDNA)是指可以從環(huán)境樣品(如水、土壤、空氣、冰芯等)中直接提取到的DNA 片段總和。eDNA  技術是近年來新出現(xiàn)的一種生物調查方法技術,由 包括eDNA 獲取、基因分析和結果分析 3 個部分組成。與傳統(tǒng)方法相比,eDNA  技術具有靈敏度高, 省時省力, 對調查對象無損傷等優(yōu)點,而且不要求調查人員具有傳統(tǒng)的生物識別及鑒定經驗。目前eDNA  技術已被應用于目標物種(如入侵物種、瀕危物種及其他稀有物種)"有無"的檢測, 生物量的估測,在水生生態(tài)系統(tǒng)的保護中具有廣泛的應用前景。

應用領域:魚類資源調查、微生物研究、入侵生物監(jiān)測預防、水生物保護(江豚、白鰭豚)、兩棲動物監(jiān)測


一 硬件選擇  

1、便攜式eDNA采樣機

型號:Citizen




(便攜、操作簡便、自封式濾膜*)

特點

無須培訓,操作簡單

快速過濾大體積水樣

可使用自封濾膜*

一鍵現(xiàn)場過濾

適配自封式濾膜

eDNA魚類種群采樣調查系統(tǒng)技術信息

水泵:空氣泵                           攜帶方式:手提式

電壓:12V                              eDNA保存時間:常溫>90個自然日

電池壽命:8小時                       抽濾速度:1L/min

容積:2L                               電池類型:鉛酸蓄電池

管徑:0.25英寸

專用自封式濾膜:0.45μm,1.2μm,5μm   材質:PES或其他


2、移動式eDNA采樣站



                 

(移動式采樣站點、多通道平行采樣、智能化采樣)

設備特點

可記錄采樣點流速、GPS、溫度等信息

內置計算機,可導出采樣日志、為每個樣品標注采樣編碼

采樣飽和后具有震動反饋功能,可設置定量采水

具備遠程藍牙遙控采水功能

可進行多通道的同步采樣

自封濾膜(技術):采用合成樹脂材料自動對樣本進行脫水處理,使DNA信息能在室溫下保存90天不降解(傳統(tǒng)采樣方式需要對樣品進行乙醇加注、冷凍、防腐等措施,費時費力,往往會在采樣點浪費大量時間)

①降低污染——傳統(tǒng)樣品處理方式需要現(xiàn)場對樣品進行防腐處理,會增加污染可能。

②提高DNA含量——與傳統(tǒng)使用乙醇相比,檢測到的DNA含量是其2倍。

③提高效率——現(xiàn)場無需準備乙醇及緩慢的過濾工作,無需準備冷凍措施低溫保存樣品,即便是沒有相關從業(yè)經驗的人員即可快速上手實現(xiàn)標準化的采樣工作。

技術信息:

最小流速:0.1 L/minute

最大流速:1.4 L/minute

最大采樣水樣量:999.9 L

容量精度:> 90% 0.1 L/分鐘

電池續(xù)航時間:≥8 小時

采樣點 GPS 位置精度:2.5 米

濾膜材質:PES

過濾器材質:合成樹脂

采樣桿長度:3 米(可延長收攏)

遠程遙控器續(xù)航:4 小時

采樣器重量:不超過 11kg

伸縮桿重量:不超過 4kg


采樣站構成

1、智能化采樣站主機  2、多通道采樣桿  3、采樣軟管  4、eDNA過濾器—自封式濾膜*   5、鉛酸蓄電池—提供12小時續(xù)航時間  6、GPS采樣坐標定位儀



3、背負式eDNA采樣器

型號:ESBL-BACKPACK



(背負式、移動式采樣、多通道平行采樣、智能化采樣)

設備特點

支持背負式移動采樣

可記錄采樣點流速、GPS、溫度等信息

內置計算機,可導出采樣日志、為每個樣品標注采樣編碼

采樣飽和后具有震動反饋功能,可設置定量采水

具備遠程藍牙遙控采水功能

可進行伸縮式采樣——3米延長桿

自封濾膜:采用合成樹脂材料自動對樣本進行脫水處理,使DNA信息能在室溫下保存90天不降解(傳統(tǒng)采樣方式需要對樣品進行乙醇加注、冷凍、防腐等措施,費時費力,往往會在采樣點浪費大量時間)

①降低污染——傳統(tǒng)樣品處理方式需要現(xiàn)場對樣品進行防腐處理,會增加污染可能。

②提高DNA含量——與傳統(tǒng)使用乙醇相比,檢測到的DNA含量是其2倍。

③提高效率——現(xiàn)場無需準備乙醇及緩慢的過濾工作,無需準備冷凍措施低溫保存樣品,即便是沒有相關從業(yè)經驗的人員即可快速上手實現(xiàn)標準化的采樣工作


采樣器構成

1.  背負式采樣機主機

2.  采樣軟管

3.  3米伸縮式采樣桿

4.  遠程采水遙控器

5.  4 節(jié)5 號充電池和充電器

6.  9.6 伏鎳鎘充電池/充電器

7.  Microtube 微管儲存箱

8.  系統(tǒng)使用快速入門簡介

9.  過濾器—自封式濾膜

10. GPS采樣定位儀

二  耗材選擇

1、傳統(tǒng)濾膜過濾器

——同時兼容上述eDNA專用采樣器




(傳統(tǒng)濾膜)




介紹

傳統(tǒng)濾膜過濾器需要在現(xiàn)場采樣完后,穿戴無菌手套,用鑷子取出濾膜,加注緩沖保存液,在24小時內低溫送至實驗室進行后續(xù)分析。


技術信息

壓力范圍:0~0.85bar

環(huán)境操作溫度:0~40℃

兼容采樣管徑:內徑0.25英寸

濾膜孔徑:0.45微米,1.2微米,5微米

建議濾水量:1~10L

存儲溫度:22℃

外殼類型:封閉式錐形過濾殼體

















2、自封式濾膜過濾器Self-preserving filter

                                     ——同時兼容上述eDNA專用采樣器



(DNA獲取量為普通濾膜的2倍)



介紹

自封濾膜:采用合成樹脂材料自動對樣本進行脫水處理,使DNA信息能在室溫下保存90天不降解(傳統(tǒng)采樣方式需要對樣品進行乙醇加注、冷凍、防腐等措施,費時費力,往往會在采樣點浪費大量時間)

優(yōu)點

①降低污染——傳統(tǒng)樣品處理方式需要現(xiàn)場對樣品進行防腐處理,會增加污染可能。

②提高DNA含量——與傳統(tǒng)使用乙醇相比,檢測到的DNA含量是其2倍。

③提高效率——現(xiàn)場無需準備乙醇及緩慢的過濾工作,無需準備冷凍措施低溫保存樣品,即便是沒有相關從業(yè)經驗的人員即可快速上手實現(xiàn)標準化的采樣工作




自封式濾膜的使用





三  eDNA實驗室分析

樣品(q)PCR分析并出具報告


       樣品分析由上海合作實驗室進行分析,用戶所使用的濾膜必須為廠家提供的自封式濾膜,郵寄至廠商接收點(常溫、無需使用乙醇等固定液),2周內即可獲取結題報告。


自封式濾膜可參閱文獻:

A self‐preserving, partially biodegradable eDNA filter


1、流程



環(huán)境DNA提取——設計合成引物接頭——PCR擴增產物純化——PCR產物定量均一化——測序文庫構建——高通量測序——生成報告



2、樣品報告包括但不限于:


1、物種多樣性統(tǒng)計

2、物種組成分析

3、群落比較分析

4、捕撈數(shù)據(jù)一致性分析

5、... ...




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